حسن روحانی دارای تألیفات، تحقیقات و مقالات علمی فراوانی است که حدود 100 اثر از ایشان به صورت کتاب یا مقاله منتشر شده است. همچنین بیش از 700 تحقیق راهبردی با مدیریت و نظارت وی در 20 سال گذشته به انجام رسیده است. اهم تألیفات وی به این شرح است:
کتب
1. امنیت ملی و دیپلماسی هسته‌ای – 1390
2. امنیت ملی و نظام اقتصادی ایران – 1389
3. اندیشه‌های سیاسی اسلام؛ جلد اول: مبانی نظری – 1388
4. اندیشه‌های سیاسی اسلام؛ جلد دوم: سیاست خارجی – 1388
5. اندیشه‌های سیاسی اسلام؛ جلد سوم: مسائل فرهنگی و اجتماعی – 1388
6. خاطرات دکتر حسن روحانی؛ جلد اول: انقلاب اسلامی – 1387
7. مقدمه‌ای بر تاریخ امامان شیعه – 1391
8. سن اهلیت و مسئولیت قانونی – 1391
9. آشنایی با کشورهای اسلامی – 1387
10. انقلاب اسلامی؛ ریشه‌ها و چالش‌ها – 1376
11. مبانی تفکر سیاسی امام خمینی (ره) – 1378
12. نقش حوزه‌های علمیه در تحولات اخلاقی و سیاسی جامعه – 1390
13. امنیت ملی و سیاست خارجی – آماده چاپ
14. امنیت ملی و محیط زیست – آماده چاپ
15. خاطرات دکتر حسن روحانی؛ جلد دوم: دفاع مقدس – آماده چاپ
16.  The Islamic Legislative Power – 1994
17.  The Flexibility of Shariah; Islamic Law – 1996
مقالات
گفتمان امام خمینی(ره) پیرامون امنیت ملی و سیاست خارجی (بهمن 1391)
سرمایه خانواده، سنگ بنای سرمایه‌ اجتماعی (خرداد 1390)
خانواده، سرمایه خانواده و چالش‌های فراروی جامعه ما (دی 1389)
درآمدی بر مؤلفه‌های اساسی محیطی در چشم‌انداز ایران (شهریور 1389)
زمینه‌ها و رویکردهای پژوهش کیفی (اردیبهشت 1389)
درآمدی بر نظریه سرمایه فرهنگی (دی 1388)
چشم‌انداز خاورمیانه: تداوم نگاه غرب، یا نگاهی جدید (آبان 1388)
دین و روابط بین‌الملل؛ پارادوکسها و ضرورتها (اردیبهشت 1388)
رویکردهای حوزه‌های علمیه و بایستگی‌های نوین (بهمن 1387)
مهندسی فرهنگی: از نظریه تا عمل (تیر 1387)
رسانه‌های گروهی و امنیت ملی (دی 1386)
بایستگی آموزش مهارت‌های زندگی در آموزش و پرورش (مهر 1386)
درآمدی بر سرمایه‌گذاری فرهنگی (تیر 1386)
توسعه نباید در حد آرزو باقی بماند (فروردین 1386)
نقش آموزش و پرورش در انسجام اجتماعی (دی 1385)
درآمدی بر کارآمدی مجلس خبرگان (مهر 1385)
چالشهای فراروی عراق جدید (تیر 1385)
ثروت ملی یا قدرت ملی؟ اولویت با کدام است؟ (فروردین 1385)
همبستگی ملی و مشارکت عمومی (دی 1384)
فراسوی چالش‌های ایران و آژانس در پرونده هسته‌ای (مهر 1384)
پایبندی ما به رژیمهای عدم اشاعه از موضع باورمندی ماست (تیر 1384)
تدبیرهای ایران توان آینده‌نگری را از آمریکاییها گرفت (فروردین 1384)
خط قرمز فناوری سوخت؛ با رویکرد تعامل مؤثر پیش می‌رویم (دی 1383)
نهضت خدمت‌رسانی از شعار تا کردار (مهر 1383)
خودمداری سیاستمداران امریکا و شیوه‌های حفاظت از منافع ملی ما (دی 1382)
استراتژی جمهوری اسلامی ایران در قبال فرسایش حاکمیت دولت‌ها (مهر 1382)
مفهوم جدید حاکمیت ملی یا فرسایش حاکمیت‌ها (تیر 1382)
تکانه‌های آسیب‌های اجتماعی و پیامدهای ناگوار (فروردین 1382)
تروریسم، بحران خاورمیانه و روابط ایران و آمریکا (مهر 1381)
استراتژی جمهوری اسلامی ایران در برابر تهدیدات اخیر امریکا (تیر 1381)
پیرامون مواضع اخیر آمریکا در قبال جمهوری اسلامی ایران (دی 1380)
انفجارهای امریکا و منافع ملی جمهوری اسلامی (مهر 1380)
امنیت عمومی، امنیت ملی و چالش‌های فراروی (تیر 1380)
فناوری؛ مدارهای توسعه و چالش‌های ایران (فروردین 1380)
درآمدی بر مشروعیت و کارآمدی (دی 1379)