سیدموسی شبیری زنجانی در سال ۱۳۰۶ شمسی در شهر مقدس قم به دنیا آمد. پدرش آیت‌الله سیداحمد حسینی ‌‌‌زنجانی از مدرّسان دروس عالی حوزۀ علمیۀ قم و امام جماعت حرم حضرت معصومه(س) بود.